Sejarah berdirinya
Ponpes Al-Furqan ini adalah pengembangan dari Madrasah Tsanawiyah yang mulai dibangun pada tanggal 29 September 2004 di atas tanah wakaf Hj. Zubaidah dgn ukuran 15 m x 18,5 = 277 M3 dan tanah yang dibeli dengan st. Zubaidah binti doul 17m x 10 m = 170 M3.
Pada Juli tahun ajaran 2005 / 2006 dibuka MTs M3 Al-Furqan dengan jumlah siswa pertama 30 orang di lokasi I (Jl. Sultan Adam Kadar Permai II Ujung). Dengan kamad pa Abdul Baqi. Lembaga pendidikan ini dibangun dibawah Cabang Muhammadiyah Bjm 3, yang diketuai oleh Pa Murhan dan Sekretaris Hernadi dan bendahara Hj. Sukmawati Dahlan. Pada tahun ajaran berikutnya 2006 / 2007 dibuka Madrasah Ibtidaiyah dengan menggunakan Gedung yang sama dengan jumlah siswa sebanyak 54 orang (dua kelas) dan sebagai Kamad Pa Sholihin. Pada tahun berikutnya (2007/2008) di bangun gedung baru dilokasi baru (Jl. Cemara Ujung Awang Sejahtera) untuk MTs. Dan pada tahun itu pula pindah ketempat baru dengan dengan penyempurnaan panitia yang diketuai oleh Pa Murhan dan Sekretaris Pa Manaf dan Bendahara Ibu Ni’mah Fithria, S.Pt. yang langsung diresmikan oleh pa Gub Rudy Arifin pada tagl 15 Juni 2008. (seperti prasati) dgan Tabligh Akbar bersama Amien Rais. Maka pada semeseter genap tahun ajaran 2007/2008
Dan pada tahun ajaran 2007/2009 di buka juga SMA M 3 dengan kepala Sekolah pa H. Rudiannor. S.Pd, S.PdI . kemudian pada tgl 11 Februari 2010 dibuka Program Tahfizul Qur’an yang dipimpin oleh Abdul Wahid, SQ, S.Ag. dengan jumlah pendaftar pertama 43 orang (putra dan Putri).